In der Regel fließt das Abwasser im natürlichen Gefälle zur Kläranlage, die an der Bünningstedter Str. auch am tiefsten Punkt der Stadt liegt. Aufgrund der Größe des Stadtgebiets und zur überwindung von geologischen Höhendifferenzen ist dies jedoch nicht vollständig möglich. Deshalb erfolgt in verschiedenen Stadtteilen zunächst eine lokale Zusammenführung zu Pumpstationen. Hier wird das Abwasser mit starken Pumpen durch Druckrohrleitungen in das nächst höhergelegene Stadtviertel gepumpt. Von hier läuft es wieder zur nächsten Pumpstation oder endgültig zur Kläranlage. Das Ahrensburger Kanalnetz umfasst 15 Schmutzwasserpumpwerke und ein Regenwasserpumpwerk.